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2019年7月由科技部、国家卫生健康委、军委后勤保障部和原食品药品监管总局正式批准依托解放军总医院第五医学中心成立国家感染性疾病临床医学研究中心。研究中心整合国内79家协作医院，针对慢性乙肝、慢性丙肝、艾滋病及其相关疾病等病种，建立病程涵盖临床各个阶段的大队列，同时建立标准化的生物样本库、临床诊疗信息库及的疾病发病追踪系统，形成涵盖重大感染性疾病及各个病程的资源平台，终建立我国规范的病毒性肝炎、艾滋病临床大数据及生物样本库整合平台，形成专业的管理团队，为建立符合我国人群特点的肝病、艾滋病诊疗体系提供重要战略性资源。
国家骨科与运动康复临床医学研究中心由国家科技部、卫健委、军委后勤保障部和国家药监局于2019年5月正式批复成立，是目前国内骨科与运动康复领域的临床医学研究中心。中心依托单位为中国人民解放军总医院，承载着强化医学科技创新体系建设、打造国家临床医学和转化研究“新高地”的重要使命与任务，始终坚持以临床需求为牵引、以转化应用为导向、以创新网络为支撑的工作思路，着力构建全生命周期的创新生态平台，开展临床研究、协同创新、成果转化、推广应用、学术交流、人才培养等工作。中心目前已开展临床研究39项，发表论文600余篇，授权国际专利13项、国家专利120余项。牵头/参与国内指南、共识40余项，开展线上/线下教育，培训人员340余万人次。开展千余次远程会诊、扶贫帮带，赋能地方医疗机构骨科诊疗能力。
解放军总医院第二医学中心老年医学科是国家老年疾病临床医学研究中心老年医学临床研究基地及全国老年慢性病医联体牵头单位。科室目前有正高职称人员3名，副高职称人员5名，形成覆盖老年心血管、呼吸、消化、肿瘤、神经内科等各亚专业的老年多学科团队。老年医学科以老年综合评估为核心技术，以全人全程管理为核心理念，强调多学科协作诊疗，利用可穿戴设备、5G等现代技术，形成集老年急性病救治、慢病管理、功能维护为一体的现代老年病管理模式，致力于构建高水平老年医学规培基地、专培基地、保健人才培训基地；新技术、新业务转化平台及老年病前沿基础研究平台，目前已有10余家协同网络单位派驻医护人员到该病房进修学习。科室围绕建立全国老年队列研究人群，构建高龄围手术期风险管控、老年多病共患综合管理等常见临床问题的防控技术体系，及衰老机制及规律等开展临床科研研究，作为项目牵头单位承担国家重点研发计划、国家自然科学基金等多项国家、军队级课题，总项目经费达1.2亿元。