国家老年疾病临床医学研究中心（解放军总医院）是由国家科技部、卫生健康委员会、军委后勤保障部和原食品药品监督管理总局于2016年7月联合批准建设的第三批国家临床医学研究中心，主任为老年医学专家范利教授，中心依托解放军总医院第二医学中心老年医学部主管主建，拥有集国家重点学科、国家临床医学研究中心、国家临床重点专科（军队建设项目）、北京市及全军重点实验室、全军保健人员培训基地“五位一体”的老年医学优势学科群，连续5年蝉联全国老年医学专科排行榜榜首，涌现出一批德高望重、造诣精深的老年医学大家，已建成体系完整、人才接续的学科体系。
2019年7月由科技部、国家卫生健康委、军委后勤保障部和原食品药品监管总局正式批准依托解放军总医院第五医学中心成立国家感染性疾病临床医学研究中心。研究中心整合国内79家协作医院，针对慢性乙肝、慢性丙肝、艾滋病及其相关疾病等病种，建立病程涵盖临床各个阶段的大队列，同时建立标准化的生物样本库、临床诊疗信息库及的疾病发病追踪系统，形成涵盖重大感染性疾病及各个病程的资源平台，终建立我国规范的病毒性肝炎、艾滋病临床大数据及生物样本库整合平台，形成专业的管理团队，为建立符合我国人群特点的肝病、艾滋病诊疗体系提供重要战略性资源。
先后牵头并主持承担了国家重大课题330多项。获国家发明专利50余项。获得新药证书7项、诊断试剂生产批件13项、军队制剂批件43项。发表病毒性肝炎相关SCI论文800篇（IF≥10论文24篇）。依靠协同创新网络推广普及病毒性肝炎相关知识。一方面紧密瞄准解决临床问题“接地气”的宏伟目标，组织开展国际化、高质量的多中心临床研究，取得具有重大临床指导意义的创新性成果，另一方面创新国际交流与合作模式，与世界大学、研究院所、医疗机构和跨国企业等建立战略合作伙伴关系，获得具有“高大上”特性的科研成果，提高学术水平和地位。
国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心，依托中国人民解放军总医院，于2019年5月由科技部、国家卫生健康委、军委后勤保障部和国家药监局正式批准成立，也是认定的国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心，中心主任为杨仕明教授。